More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1737 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  90.97 
 
 		 519 aa  839    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  949    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  57.01 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  56.05 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  55.68 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  55.58 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.92 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  57.97 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  55.53 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  55.68 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.81 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.81 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.68 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.68 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  58.62 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  56.81 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  58.62 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.01 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  54.84 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.69 
 
 		 425 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.72 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  54.69 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.08 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  53.7 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.01 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.79 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  54.27 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  53.63 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  52.94 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  53.19 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  47.59 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  52 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  47.07 
 
 		 416 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  48.52 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  47.53 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  42.07 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.39 
 
 		 478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.22 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  37.99 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  39.68 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.71 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.16 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  37.85 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.67 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  40.31 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.96 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.1 
 
 		 426 aa  219  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  36.26 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  36.47 
 
 		 432 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.78 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.19 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.52 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  38.99 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.41 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  36.26 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  39.75 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  37.44 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.53 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  40.06 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  37.56 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  37.18 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.25 
 
 		 412 aa  210  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.06 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.03 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.67 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  38.71 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  38.73 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  38.73 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.73 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.73 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.48 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  36.48 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.02 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.32 
 
 		 404 aa  203  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.82 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  39.69 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.92 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  36.69 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.88 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.71 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.99 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.18 
 
 		 403 aa  200  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.21 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  34.09 
 
 		 451 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.94 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.73 
 
 		 404 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.53 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  34.03 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  34.36 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.7 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.21 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.47 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  38.24 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>