More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3183 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  76.36 
 
 
425 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.12 
 
 
424 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  76.54 
 
 
423 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  100 
 
 
429 aa  875    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  76.36 
 
 
425 aa  658    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.36 
 
 
423 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  69.89 
 
 
470 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  72.27 
 
 
417 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  71.39 
 
 
417 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  63.74 
 
 
418 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  66.03 
 
 
419 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  55.88 
 
 
419 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  56.62 
 
 
420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  56.62 
 
 
420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  56.62 
 
 
420 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  56.37 
 
 
420 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  56.62 
 
 
420 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  56.62 
 
 
420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  56.62 
 
 
420 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  56.62 
 
 
420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  55.39 
 
 
421 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  55.64 
 
 
419 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  56 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  54.69 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.17 
 
 
420 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  54.46 
 
 
465 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  55.15 
 
 
421 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.17 
 
 
419 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.15 
 
 
421 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.17 
 
 
420 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.15 
 
 
421 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.9 
 
 
421 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  53.19 
 
 
420 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  53.92 
 
 
466 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  51.7 
 
 
447 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  54.93 
 
 
425 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  51.56 
 
 
519 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.19 
 
 
465 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  49.38 
 
 
416 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  46.9 
 
 
423 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  49.53 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.9 
 
 
478 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.38 
 
 
434 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  36.12 
 
 
454 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  38.1 
 
 
433 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.87 
 
 
426 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  38.13 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.37 
 
 
404 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  39.09 
 
 
434 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  38.41 
 
 
434 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.84 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  36.12 
 
 
429 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.39 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  36.77 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.01 
 
 
433 aa  213  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.04 
 
 
437 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  36.22 
 
 
432 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  36.96 
 
 
433 aa  209  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.34 
 
 
429 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  41.21 
 
 
451 aa  206  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.34 
 
 
446 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.57 
 
 
437 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  35.07 
 
 
428 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  40.45 
 
 
460 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  37.23 
 
 
436 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.77 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  33.56 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.84 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  41.27 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.32 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  35.48 
 
 
429 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  36.97 
 
 
437 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  33.71 
 
 
449 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.31 
 
 
459 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.92 
 
 
418 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.96 
 
 
449 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  36.88 
 
 
437 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  36.48 
 
 
404 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 
405 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  33.82 
 
 
428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.15 
 
 
404 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.24 
 
 
370 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  37.08 
 
 
367 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.18 
 
 
437 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  37.46 
 
 
449 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.06 
 
 
404 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.94 
 
 
416 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  37.14 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  37.66 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.43 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  37.7 
 
 
429 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.87 
 
 
443 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.09 
 
 
419 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.41 
 
 
429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.86 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  30.64 
 
 
455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  39.29 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4268  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.27 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  33.33 
 
 
443 aa  183  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  35.64 
 
 
446 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>