More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2497 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  75.46 
 
 		 432 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 433 aa  855    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  86.54 
 
 		 434 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  81.06 
 
 		 433 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  85.68 
 
 		 434 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  76.39 
 
 		 433 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  77.49 
 
 		 432 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.35 
 
 		 433 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  58.1 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  55.89 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.45 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.39 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  53.56 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.1 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  49.89 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  50.11 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.08 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  49.54 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  49.07 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.63 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  48.62 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.74 
 
 		 370 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  48.39 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.14 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.95 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  51.07 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  41.61 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.91 
 
 		 423 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  43.42 
 
 		 454 aa  299  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.51 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.82 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  42.83 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  38.35 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  42.38 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  42.14 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  42.14 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  42.14 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  40.38 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  42.14 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  42.14 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  42.14 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  42.14 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  42.28 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.43 
 
 		 421 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  41.43 
 
 		 421 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.43 
 
 		 421 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.58 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.55 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  38.91 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  40.33 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.02 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  41.63 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  40.31 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  39.28 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.73 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  37.87 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.94 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  40.18 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.43 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.71 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.71 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  35.78 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  38.57 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  44.72 
 
 		 519 aa  233  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  41.15 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  40.91 
 
 		 465 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  40.53 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  38.13 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  38.42 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.44 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.64 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.44 
 
 		 389 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.82 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.14 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  36.32 
 
 		 417 aa  220  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  36.07 
 
 		 392 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  38.22 
 
 		 425 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.13 
 
 		 387 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  37.64 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  37.24 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  34.64 
 
 		 391 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.72 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.67 
 
 		 437 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.66 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.59 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.56 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.03 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.03 
 
 		 404 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.03 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  38.36 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.7 
 
 		 404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.7 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  37.7 
 
 		 404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  37.7 
 
 		 404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  36.03 
 
 		 387 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.03 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.08 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  42.59 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.03 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.49 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>