More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0336 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  100 
 
 		 428 aa  875    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  69.18 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  70.59 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  71.76 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  54.5 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  50.7 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.4 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  52.94 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  52.94 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.77 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.59 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  48.28 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  48.28 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  48.96 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  49.77 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  46.05 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  46.88 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  49.07 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  46.53 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.66 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  46.53 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  45.06 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.06 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.59 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.52 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.38 
 
 		 433 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  42.47 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.51 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.68 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  39.5 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.42 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  37.44 
 
 		 454 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  36.45 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.85 
 
 		 419 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  41.4 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  37.59 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  35.21 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  35.62 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.63 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.84 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  34.62 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.85 
 
 		 419 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  37.8 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  35.07 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  41.53 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.7 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  34.7 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  34.7 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  34.55 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  34.55 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  34.55 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  34.4 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  34.55 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.79 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  34.79 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.79 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.64 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.19 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.49 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  40.06 
 
 		 519 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  35.88 
 
 		 417 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.37 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.37 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  40.85 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  40.85 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  36.41 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.24 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.97 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  34.97 
 
 		 425 aa  206  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  40.13 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.87 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  38.84 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  35.07 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  38.73 
 
 		 425 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  36.22 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.26 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.88 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  39.03 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.75 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  36.87 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.56 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.32 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  33.72 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.47 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.86 
 
 		 405 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.87 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.43 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.98 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.43 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  34.22 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.94 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2131  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.22 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.547964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0594  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.74 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  31.19 
 
 		 410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.72 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  31.3 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.2 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2309  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.55 
 
 		 404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>