More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2934 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  98.22 
 
 		 449 aa  862    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 459 aa  894    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  92.37 
 
 		 367 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  69.95 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.96 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.46 
 
 		 370 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  54.38 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.22 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  54.61 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  54.17 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  53.56 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.69 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  52.29 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  52.76 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  52.06 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  53.1 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  45.06 
 
 		 428 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.62 
 
 		 429 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.03 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  45.45 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  45.45 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  45.83 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.38 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  44.8 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  43.88 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.97 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  39.86 
 
 		 428 aa  309  9e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.72 
 
 		 423 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  42.13 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.32 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.55 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  40.73 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  41.42 
 
 		 392 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.63 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  41.29 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  39.95 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.09 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  42 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.65 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  37.33 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  37.8 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.84 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  33.66 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.44 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.09 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  36.61 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  35.73 
 
 		 423 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  36.03 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.43 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  35.43 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  38.06 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.97 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.71 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  42.02 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  36.3 
 
 		 387 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.71 
 
 		 470 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  35.31 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.5 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  35.89 
 
 		 425 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  34 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.25 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  38.07 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  34.87 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.89 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  35.89 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  35.89 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  35.89 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  35.89 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  35.89 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  35.89 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  34.11 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  36.65 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  34.63 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.87 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  40.35 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  37.35 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  40.35 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  32.95 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.63 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0594  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.07 
 
 		 383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  34.15 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.15 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.15 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.76 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.4 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.4 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.49 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.05 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.87 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  41.64 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  34.69 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.17 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  38.01 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  42.12 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.74 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  41.75 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.35 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  38.25 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  33.71 
 
 		 430 aa  156  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.76 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>