More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2178 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 430 aa  862    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.88 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  38.42 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.28 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.53 
 
 		 478 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  34.28 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  36.17 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  36.68 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.38 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  36.02 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.11 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  32.8 
 
 		 519 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.72 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  34.14 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  33.81 
 
 		 419 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.04 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.24 
 
 		 425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  35.24 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  37.38 
 
 		 396 aa  190  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  35.66 
 
 		 447 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  33.49 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  34.15 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  34.02 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  35.83 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  34.44 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  33.96 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.41 
 
 		 470 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.92 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.75 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  33.33 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  33.26 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  34.26 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  33.87 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  32.27 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  34.33 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  32.55 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.55 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.46 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.8 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  32.55 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  36.95 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  32.86 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  34.96 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  33.17 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  32.31 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.54 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  32.31 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  32.31 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  32.31 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.54 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.32 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.05 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  38.16 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.78 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.68 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.78 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  32.78 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.78 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  40.07 
 
 		 451 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  29.81 
 
 		 403 aa  170  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.18 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  33.33 
 
 		 429 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.04 
 
 		 405 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  33.97 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  34.09 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.55 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.11 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.02 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  37.58 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.93 
 
 		 416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  33.49 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.41 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  33.56 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  35.73 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  33.41 
 
 		 433 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.71 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  33.95 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  31.78 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2390  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.83 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.416115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  30.46 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2212  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.07 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369517  hitchhiker  0.00133347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  30.46 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  31.8 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  29.71 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  32.77 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  32.87 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  32.26 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  30.75 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  30.4 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.16 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  35.31 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.6 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  30.47 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  30.47 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  38.19 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.47 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2207  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.45 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.47 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.45 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>