More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3469 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
404 aa  817    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  41.65 
 
 
416 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.71 
 
 
434 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  39.29 
 
 
420 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  40.47 
 
 
419 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  39.54 
 
 
421 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  39.85 
 
 
420 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  38.07 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  39.4 
 
 
465 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  39.4 
 
 
465 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  39.65 
 
 
417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  40.25 
 
 
419 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.29 
 
 
421 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  38.78 
 
 
420 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  45.15 
 
 
447 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  39.29 
 
 
421 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.29 
 
 
420 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.29 
 
 
420 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.29 
 
 
421 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.3 
 
 
424 aa  249  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.8 
 
 
421 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.78 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  37.21 
 
 
466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  39.38 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  36.89 
 
 
425 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  36.28 
 
 
425 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.66 
 
 
425 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.82 
 
 
418 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  35.5 
 
 
423 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.26 
 
 
470 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  38.55 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.66 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  44.01 
 
 
429 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.82 
 
 
465 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.19 
 
 
415 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  33.89 
 
 
519 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.38 
 
 
423 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.33 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  36.01 
 
 
454 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  38.39 
 
 
446 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.18 
 
 
412 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.83 
 
 
404 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  37.04 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  37.04 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  33.72 
 
 
429 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  36.76 
 
 
464 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  36.1 
 
 
452 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  37.2 
 
 
403 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.25 
 
 
433 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  30.7 
 
 
416 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  38.51 
 
 
448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.33 
 
 
449 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.95 
 
 
433 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  40.45 
 
 
430 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  35.06 
 
 
460 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  37.83 
 
 
452 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.09 
 
 
423 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.73 
 
 
426 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  37.43 
 
 
427 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  35.58 
 
 
443 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.41 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  36.94 
 
 
443 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.93 
 
 
430 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.74 
 
 
446 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.72 
 
 
451 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.18 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.18 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  37.7 
 
 
427 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  37.97 
 
 
434 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.25 
 
 
437 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.14 
 
 
437 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.38 
 
 
437 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  39.36 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  34.43 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.46 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.69 
 
 
452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  39.16 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  35.37 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  31.31 
 
 
449 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.21 
 
 
457 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.54 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  35.42 
 
 
432 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  36.98 
 
 
452 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  37.99 
 
 
448 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  37.66 
 
 
448 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  31.76 
 
 
455 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.95 
 
 
459 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.11 
 
 
432 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  36.69 
 
 
433 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.21 
 
 
444 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  33.44 
 
 
440 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39 
 
 
445 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.36 
 
 
462 aa  169  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  35.33 
 
 
367 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>