More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1575 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 445 aa  884    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  73.7 
 
 		 445 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  65.66 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  57.48 
 
 		 432 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  53.67 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  53.29 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  44.55 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  44.34 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  43.88 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  44.11 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  44.37 
 
 		 446 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  46.68 
 
 		 449 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  48.14 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  44.03 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  44.47 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  44.72 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  44.42 
 
 		 451 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  41.67 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  40.4 
 
 		 464 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.26 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  38.48 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  39.15 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.28 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  39.43 
 
 		 452 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.44 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.48 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.76 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.12 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.1 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.1 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.95 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  38.11 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  34.52 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  33.63 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  34.52 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.22 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  34.08 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  34.52 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  34.08 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  34.08 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  34.3 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  34.08 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  34.08 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  35.41 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  36.52 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  32.44 
 
 		 449 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  33.86 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  35.44 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.27 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  35.28 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.64 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  36.39 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  34.51 
 
 		 447 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  35.32 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  34.72 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.54 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  35.68 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.59 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  28.6 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  32 
 
 		 456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  39.34 
 
 		 448 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.62 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.16 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  27.72 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.94 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.1 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  40.38 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  27.96 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  27.96 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  37.13 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  36.14 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  33.83 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  36.34 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.54 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  39.33 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  39.33 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  39.33 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.32 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.64 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.38 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  38.37 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  35.89 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  36.4 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  35.99 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  36.4 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.28 
 
 		 429 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  37.53 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  37.18 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  35.65 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  29.66 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  35.89 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  35.57 
 
 		 453 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  30.03 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  34.4 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  34.91 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.47 
 
 		 427 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  34.62 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  34.62 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  34.91 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>