More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1712 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  98.42 
 
 		 442 aa  882    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  100 
 
 		 442 aa  892    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  40.09 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  37.61 
 
 		 444 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  40.22 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  38.06 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36.69 
 
 		 452 aa  308  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  37.19 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.22 
 
 		 452 aa  305  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  38.01 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  38.01 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  36.43 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.25 
 
 		 447 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.49 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37.61 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  38.06 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  38.51 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.71 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  38.29 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  38.06 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  37.84 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.71 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  38.93 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.85 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  36.85 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.58 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  34.16 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  36.85 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.96 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  35.12 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.81 
 
 		 453 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.41 
 
 		 449 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.97 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  32.3 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  36.64 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.64 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.11 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  35.07 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.88 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  33.03 
 
 		 443 aa  259  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.66 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.48 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  32.59 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.81 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.63 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  36.9 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  33.33 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.65 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  32.22 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.88 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.33 
 
 		 464 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  28.92 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  32.04 
 
 		 453 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.04 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.37 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  34.72 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  33.18 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  31.71 
 
 		 449 aa  219  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.68 
 
 		 438 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.11 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  29.8 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  31.49 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  32.06 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.34 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  29.98 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  31.59 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  31.62 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  30.73 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  28.57 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  30.73 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  29.2 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  29.69 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  29.69 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  29.69 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.18 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.27 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  30.79 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.75 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  29.34 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  27.27 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.95 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  30.93 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  31.9 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  30.82 
 
 		 445 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.07 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.11 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  30.34 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  29.82 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  29.84 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  30.72 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  30.72 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  29.95 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  30.86 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  29.95 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>