More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1768 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  100 
 
 
444 aa  920    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  65.38 
 
 
445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  61.26 
 
 
451 aa  554  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  54.73 
 
 
447 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  55.45 
 
 
429 aa  474  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  53.17 
 
 
442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  50.11 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  37.58 
 
 
453 aa  274  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.98 
 
 
452 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  33.93 
 
 
455 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  35.4 
 
 
468 aa  257  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.1 
 
 
453 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.24 
 
 
452 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  34.68 
 
 
449 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.95 
 
 
444 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.91 
 
 
456 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.18 
 
 
446 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  35.38 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  34.81 
 
 
451 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  34.59 
 
 
451 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.33 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.48 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.4 
 
 
448 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  31.7 
 
 
444 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.62 
 
 
449 aa  230  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  32.14 
 
 
444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  32.29 
 
 
444 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.96 
 
 
451 aa  227  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.22 
 
 
453 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  33.7 
 
 
447 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.52 
 
 
444 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  32.14 
 
 
444 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  31.92 
 
 
444 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  31.92 
 
 
444 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  31.92 
 
 
444 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  31.92 
 
 
444 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.96 
 
 
446 aa  226  9e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.52 
 
 
444 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.7 
 
 
448 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.51 
 
 
444 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.08 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  32.89 
 
 
443 aa  223  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  32.66 
 
 
444 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.32 
 
 
440 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.61 
 
 
448 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.5 
 
 
443 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.59 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  33.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  29.76 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  31.39 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.27 
 
 
452 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.72 
 
 
445 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  31.65 
 
 
451 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.94 
 
 
471 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  33.81 
 
 
450 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  33.66 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.07 
 
 
442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  29.87 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.62 
 
 
442 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  32.23 
 
 
437 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  32.5 
 
 
431 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  28.22 
 
 
428 aa  192  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  27.85 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.11 
 
 
428 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  32.85 
 
 
438 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  32 
 
 
431 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.13 
 
 
406 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2843  sun protein  32.46 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  32.61 
 
 
438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  31.79 
 
 
430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  31.4 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.13 
 
 
438 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  33.75 
 
 
426 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  29.36 
 
 
449 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  31.99 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.19 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  25.84 
 
 
435 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0561  sun protein  31.84 
 
 
412 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.494153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  25.84 
 
 
435 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  32.7 
 
 
431 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31.26 
 
 
436 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  30.1 
 
 
448 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  32.44 
 
 
429 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.71 
 
 
425 aa  176  9e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  32.03 
 
 
429 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  31.36 
 
 
436 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  31.81 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  32.44 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  30.36 
 
 
427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  32.6 
 
 
428 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.47 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  29.79 
 
 
440 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  31.14 
 
 
434 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  31.63 
 
 
427 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  30.51 
 
 
437 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  31.86 
 
 
428 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  31.86 
 
 
428 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  30.63 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.5 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  30.63 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>