More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0561 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0561  sun protein  100 
 
 
412 aa  838    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.494153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  36.34 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  37 
 
 
452 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.54 
 
 
448 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.16 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.2 
 
 
446 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.01 
 
 
464 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.33 
 
 
448 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  34.24 
 
 
451 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.78 
 
 
448 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  34.24 
 
 
451 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.98 
 
 
444 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.59 
 
 
451 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  34.08 
 
 
445 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.66 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  33.89 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.3 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.43 
 
 
449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  31.51 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.65 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.4 
 
 
449 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.71 
 
 
429 aa  192  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.59 
 
 
451 aa  192  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  37.37 
 
 
429 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  32.58 
 
 
432 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  37.37 
 
 
429 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  37.37 
 
 
435 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  33.56 
 
 
450 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.42 
 
 
453 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.2 
 
 
446 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  30.96 
 
 
444 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.05 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.73 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.49 
 
 
436 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  32.13 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.63 
 
 
451 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.5 
 
 
444 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.5 
 
 
444 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.5 
 
 
444 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.5 
 
 
444 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.28 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.35 
 
 
440 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  30.05 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.05 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.84 
 
 
436 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.11 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  29.59 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  35.56 
 
 
431 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.69 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  32.43 
 
 
468 aa  180  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  32.75 
 
 
430 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  34.79 
 
 
434 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  27.93 
 
 
455 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  31.84 
 
 
444 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  34.2 
 
 
429 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  32.61 
 
 
437 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.59 
 
 
456 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.23 
 
 
447 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  33.33 
 
 
447 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.51 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.38 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.26 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  30.22 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  34.26 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  34.26 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  34.26 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  34.26 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  34.26 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.52 
 
 
447 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  26.67 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.26 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  28.21 
 
 
440 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.06 
 
 
426 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  36.09 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  35.18 
 
 
429 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.77 
 
 
449 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.97 
 
 
427 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  33.42 
 
 
429 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.63 
 
 
444 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  30.57 
 
 
452 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  32.82 
 
 
429 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.5 
 
 
428 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  34.01 
 
 
429 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  30.59 
 
 
448 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 
429 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.42 
 
 
429 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  33.49 
 
 
427 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4031  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.8 
 
 
488 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29109  normal  0.0353537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  34.75 
 
 
431 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  25.78 
 
 
428 aa  169  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  32.23 
 
 
427 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  32.82 
 
 
429 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.82 
 
 
429 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.01 
 
 
442 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  33.5 
 
 
429 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  32.41 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  33.7 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  31.98 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  28.68 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.01 
 
 
438 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>