More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0150 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  100 
 
 
449 aa  919    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  43.08 
 
 
446 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  43.15 
 
 
448 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  41.03 
 
 
448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  41.59 
 
 
468 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  40.13 
 
 
448 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  39.46 
 
 
448 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  41.99 
 
 
452 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  38.24 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  38.85 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.51 
 
 
455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.71 
 
 
452 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  38.08 
 
 
443 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  38.98 
 
 
443 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.17 
 
 
449 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  38.05 
 
 
451 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  37.47 
 
 
446 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  33.71 
 
 
449 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  37.83 
 
 
451 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  38.58 
 
 
444 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.31 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.55 
 
 
451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  36.83 
 
 
447 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  39.47 
 
 
464 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  36.3 
 
 
452 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.11 
 
 
457 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.3 
 
 
452 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.84 
 
 
451 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  33.03 
 
 
444 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.46 
 
 
462 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.08 
 
 
442 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  33.41 
 
 
442 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  33.33 
 
 
444 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.74 
 
 
444 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.63 
 
 
456 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.7 
 
 
453 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  32.52 
 
 
444 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  33.63 
 
 
440 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.07 
 
 
444 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  31.99 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  32.52 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  32.29 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  32.07 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  32.07 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  32.07 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  32.07 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  37.14 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  36.18 
 
 
438 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  35.93 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  35.93 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  35.84 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  33.49 
 
 
437 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  32.59 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  34.48 
 
 
431 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  32.96 
 
 
431 aa  236  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  37.94 
 
 
445 aa  232  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  31.68 
 
 
406 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  36.38 
 
 
420 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  36.38 
 
 
420 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  36.38 
 
 
420 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  36.38 
 
 
420 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.15 
 
 
420 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  36.15 
 
 
420 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  36.15 
 
 
420 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  33.62 
 
 
444 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  35.39 
 
 
448 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  33.11 
 
 
447 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.91 
 
 
435 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  33.62 
 
 
451 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  35.9 
 
 
420 aa  227  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.58 
 
 
438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  35.73 
 
 
450 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.41 
 
 
445 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  35.93 
 
 
501 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  35.78 
 
 
439 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  32.74 
 
 
432 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  41.33 
 
 
465 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  29.56 
 
 
435 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  35.12 
 
 
429 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  41.33 
 
 
465 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.47 
 
 
429 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.42 
 
 
420 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.42 
 
 
420 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.82 
 
 
424 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  29.56 
 
 
435 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  35.75 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  30.89 
 
 
449 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.66 
 
 
421 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  40.6 
 
 
419 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  36.41 
 
 
452 aa  216  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  35.18 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.78 
 
 
429 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  34.54 
 
 
429 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  34.54 
 
 
429 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.18 
 
 
421 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  39.18 
 
 
447 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  34.54 
 
 
429 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  34.54 
 
 
429 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  35.18 
 
 
429 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.33 
 
 
438 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>