More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1042 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
406 aa  816    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  38.93 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.44 
 
 
442 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  39 
 
 
444 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  35.92 
 
 
449 aa  262  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.73 
 
 
462 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.66 
 
 
444 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.84 
 
 
455 aa  249  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.71 
 
 
448 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  34.93 
 
 
447 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.9 
 
 
446 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  33.1 
 
 
452 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.69 
 
 
448 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  33.98 
 
 
444 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  34.13 
 
 
444 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  36.93 
 
 
449 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  33.25 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.78 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.28 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.57 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.25 
 
 
444 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.25 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.25 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  31.68 
 
 
449 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  32.77 
 
 
452 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  32.68 
 
 
435 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  33.01 
 
 
444 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  33.01 
 
 
444 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  33.01 
 
 
444 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  33.01 
 
 
444 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.78 
 
 
453 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  38.54 
 
 
430 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.1 
 
 
452 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  32.52 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  32.52 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  30.17 
 
 
468 aa  216  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.9 
 
 
424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  33.06 
 
 
440 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  32.26 
 
 
448 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  29.09 
 
 
451 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.67 
 
 
448 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  29.43 
 
 
457 aa  206  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  33.42 
 
 
430 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.69 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  30.08 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.19 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.69 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  32.2 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  31.91 
 
 
453 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.34 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  29.2 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  34.14 
 
 
442 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.4 
 
 
456 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.26 
 
 
446 aa  196  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  32.46 
 
 
440 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  28.74 
 
 
453 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  27.14 
 
 
443 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.95 
 
 
429 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  30.33 
 
 
452 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  30.77 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  32.59 
 
 
437 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.81 
 
 
443 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.84 
 
 
438 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  32.84 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  31.01 
 
 
439 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  28.92 
 
 
427 aa  189  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  31.81 
 
 
429 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  31.57 
 
 
429 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  31.57 
 
 
429 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.92 
 
 
425 aa  188  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  31.57 
 
 
429 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.57 
 
 
429 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  31.57 
 
 
429 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  28.11 
 
 
501 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  31.33 
 
 
429 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  32.13 
 
 
444 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  32.86 
 
 
429 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  30.58 
 
 
431 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  31.33 
 
 
429 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  31.3 
 
 
434 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.23 
 
 
440 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  31.08 
 
 
429 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.85 
 
 
427 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  31.53 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  28.44 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  32.09 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.79 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  27.64 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  29.66 
 
 
425 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  30.7 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  29.08 
 
 
431 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  29.95 
 
 
435 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  30.36 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  29.81 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  30.36 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  32.46 
 
 
437 aa  180  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  30.46 
 
 
429 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  30.46 
 
 
429 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  30.12 
 
 
429 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  30.12 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>