More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2100 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  80.42 
 
 		 425 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  72.56 
 
 		 470 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  76.36 
 
 		 423 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 423 aa  843    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  75.36 
 
 		 429 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  80.42 
 
 		 425 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  78.96 
 
 		 424 aa  668    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  71.8 
 
 		 417 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  72.27 
 
 		 417 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  64.07 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  65.8 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  55.11 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  55.11 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  54.59 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  55.11 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  55.11 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  54.87 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  57.46 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  54.87 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  54.87 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  54.16 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  55.12 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  53.92 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  55.94 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  57.55 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  57.55 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.44 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.44 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.97 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  52.97 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.92 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.97 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.97 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  55.17 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  53.4 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  52.24 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  51.94 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.24 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  50.62 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  49.4 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  50.6 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.28 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  42.79 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.69 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.01 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  39.64 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.64 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  38.6 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  39.11 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  37.84 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  38.14 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  43.5 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.13 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  37.56 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.84 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  36.95 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.25 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.39 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.88 
 
 		 404 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  38.58 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  36.82 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.38 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  36.82 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.48 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  36.53 
 
 		 449 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.97 
 
 		 459 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.65 
 
 		 437 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  34.71 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.48 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  36.11 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.12 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  37.8 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.32 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  36.4 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  39.39 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  34.65 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.1 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  36.59 
 
 		 429 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.78 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  32.71 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  35.2 
 
 		 460 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.9 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.46 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  38.66 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.32 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  38.54 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.75 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.4 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.41 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  33.44 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.08 
 
 		 448 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.49 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  37.86 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.3 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  35.75 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.38 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.18 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  36.3 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  36.64 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.64 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>