More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0966 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  85.01 
 
 
427 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
437 aa  829    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  71.43 
 
 
449 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2934  Fmu (Sun) domain-containing protein  70.96 
 
 
459 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  59.26 
 
 
433 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  58.76 
 
 
432 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  57.37 
 
 
432 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  69.67 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  58.8 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  57.18 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  57.97 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.56 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  58.39 
 
 
433 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  56.94 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3116  Fmu (Sun) domain protein  67.67 
 
 
367 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.37 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  48.95 
 
 
428 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  49.77 
 
 
427 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.72 
 
 
429 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  49.07 
 
 
429 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  49.07 
 
 
429 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.61 
 
 
429 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  43.16 
 
 
428 aa  347  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.14 
 
 
437 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  46.98 
 
 
429 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  47.91 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.84 
 
 
423 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.42 
 
 
433 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  42.89 
 
 
454 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.42 
 
 
426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.06 
 
 
478 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  43.84 
 
 
429 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  41.3 
 
 
395 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  36.43 
 
 
423 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0455  NOL1/NOP2/sun family protein  41.37 
 
 
387 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2108  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.55 
 
 
387 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.33 
 
 
389 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.95 
 
 
415 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  35.35 
 
 
416 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2376  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.43 
 
 
399 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.194397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  39.53 
 
 
392 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.38 
 
 
418 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  37.41 
 
 
417 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.5 
 
 
417 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  37.93 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  38.64 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  37.94 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  37.22 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.22 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  36.7 
 
 
429 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  38.85 
 
 
419 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  36.71 
 
 
391 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.51 
 
 
423 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  36.93 
 
 
423 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.77 
 
 
419 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  37.44 
 
 
420 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  42.33 
 
 
425 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  37.08 
 
 
420 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  42.22 
 
 
519 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  39.72 
 
 
396 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.14 
 
 
465 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.67 
 
 
424 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.56 
 
 
419 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.27 
 
 
437 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.82 
 
 
470 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  35.39 
 
 
421 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  41.93 
 
 
466 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  36.67 
 
 
417 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  35.61 
 
 
419 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.78 
 
 
420 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.78 
 
 
420 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  40.4 
 
 
465 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  40.4 
 
 
465 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.67 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1983  Fmu (Sun)  38.03 
 
 
387 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100051  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.92 
 
 
421 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  34.92 
 
 
421 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.92 
 
 
421 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  47.1 
 
 
436 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  33.1 
 
 
410 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.14 
 
 
404 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  40.31 
 
 
460 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  38.59 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  32.57 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  33.67 
 
 
412 aa  173  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  47.06 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  46.41 
 
 
437 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.77 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.63 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0594  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.94 
 
 
383 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.99 
 
 
405 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.18 
 
 
404 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  27.27 
 
 
452 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.93 
 
 
452 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>