More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1209 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  956    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  58.52 
 
 		 464 aa  551  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.6 
 
 		 449 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.67 
 
 		 453 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.2 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.54 
 
 		 453 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.67 
 
 		 459 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  58.31 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.09 
 
 		 453 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  56.68 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.09 
 
 		 457 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.41 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.09 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.92 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.33 
 
 		 475 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  48.81 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  32.18 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  31.05 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  31.94 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.94 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.94 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.02 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.02 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  31.41 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.41 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  31.41 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  31.41 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  31.41 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  31.41 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  31.64 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  31.41 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  30.34 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.79 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  31.52 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  30.02 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.49 
 
 		 451 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  29.56 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.02 
 
 		 421 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  30.34 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  29.4 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  30.39 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  30.26 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  29.71 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  29.17 
 
 		 519 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  28.41 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.75 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.11 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  29.75 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  30.18 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  29.25 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.08 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.32 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.37 
 
 		 470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.61 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.63 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  28.44 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  29.22 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  29.32 
 
 		 417 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  27.54 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.34 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  32 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.47 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  29.68 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  31.52 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.71 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  30.13 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  31.25 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  31.25 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.56 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  27.25 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  29.66 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  29.91 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  29.97 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  27.67 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  31.1 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31.89 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.53 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.53 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.53 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.53 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  29.32 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.55 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.35 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.62 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.18 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.02 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  30.65 
 
 		 468 aa  142  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  30.18 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  34.12 
 
 		 434 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.53 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.75 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.39 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  29.19 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.18 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.2 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  28.01 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  31.44 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.34 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.64 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.17 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>