More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2091 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  863    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  27.74 
 
 
486 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.91 
 
 
469 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.02 
 
 
458 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.7 
 
 
457 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.04 
 
 
457 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.61 
 
 
449 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.26 
 
 
453 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.2 
 
 
418 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.29 
 
 
463 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  28.54 
 
 
463 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.29 
 
 
453 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.75 
 
 
453 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  32.47 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.78 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  30.65 
 
 
464 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.32 
 
 
437 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  40.93 
 
 
519 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.21 
 
 
460 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  37.12 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  37.12 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.45 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  35.35 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  41.9 
 
 
451 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.11 
 
 
459 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  37.97 
 
 
423 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.01 
 
 
443 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.71 
 
 
420 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  33.83 
 
 
429 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  32.71 
 
 
420 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  32.71 
 
 
420 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  32.71 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  32.71 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  32.71 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  32.33 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  36.06 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  32.71 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  38.5 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  41.14 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  38 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.76 
 
 
462 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  38.83 
 
 
416 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  40.64 
 
 
434 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  38.5 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.2 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  39.35 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  40.56 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.5 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.5 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  38.21 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  38.46 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  36.76 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.45 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  28.88 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  36.87 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.5 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  37.37 
 
 
432 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  42.7 
 
 
395 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.5 
 
 
421 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.45 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  26.41 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  40.23 
 
 
446 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  37.77 
 
 
412 aa  129  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  40.41 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  35.1 
 
 
430 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  38.02 
 
 
419 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.24 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  37.97 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  35.24 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.9 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.24 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  36.98 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  35.66 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.68 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  33.85 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.21 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  38.02 
 
 
419 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.44 
 
 
389 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  37.78 
 
 
444 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  42.01 
 
 
452 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.4 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 
449 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.85 
 
 
417 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1739  Fmu (Sun)  38.83 
 
 
404 aa  126  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.74 
 
 
404 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  32.14 
 
 
449 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  37.5 
 
 
468 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  33.58 
 
 
428 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  38.59 
 
 
428 aa  124  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  34.93 
 
 
465 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  37.36 
 
 
466 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  36.52 
 
 
448 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  35.2 
 
 
465 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.92 
 
 
404 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  38.38 
 
 
403 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  38.66 
 
 
404 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 
438 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.35 
 
 
418 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  39.25 
 
 
433 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  29.9 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>