More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3846 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
451 aa  894    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  32.41 
 
 
464 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.49 
 
 
458 aa  193  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.41 
 
 
475 aa  192  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  32.56 
 
 
486 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.72 
 
 
453 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.95 
 
 
469 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.36 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.64 
 
 
457 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.81 
 
 
460 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.48 
 
 
463 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  32.33 
 
 
463 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.65 
 
 
459 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.87 
 
 
453 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.77 
 
 
449 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.57 
 
 
453 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  33.33 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0406  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.89 
 
 
389 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  33.41 
 
 
454 aa  163  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.88 
 
 
433 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  37.75 
 
 
434 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.85 
 
 
433 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  36.2 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  37.46 
 
 
447 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  36.5 
 
 
420 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  35.58 
 
 
465 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  35.69 
 
 
420 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  35.58 
 
 
465 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  35.38 
 
 
420 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  35.38 
 
 
420 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  32.71 
 
 
429 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  35.38 
 
 
420 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  24.04 
 
 
435 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  36.47 
 
 
417 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  30.19 
 
 
423 aa  150  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.54 
 
 
437 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  36.31 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  35.37 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  35.08 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  35.08 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  33.26 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  35.08 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  35.08 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.1 
 
 
420 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.56 
 
 
417 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.1 
 
 
420 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.69 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  35.69 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.69 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  37.23 
 
 
419 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  34.34 
 
 
466 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.73 
 
 
421 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  35.92 
 
 
430 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  23.36 
 
 
435 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  23.36 
 
 
435 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  28.01 
 
 
403 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.77 
 
 
404 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.98 
 
 
478 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.38 
 
 
419 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  29.07 
 
 
412 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  34.95 
 
 
416 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  28.34 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  33.79 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  31.22 
 
 
429 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  31.22 
 
 
429 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.5 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.94 
 
 
425 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.54 
 
 
418 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  34.94 
 
 
425 aa  140  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  33.33 
 
 
432 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  29.79 
 
 
428 aa  139  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  33.73 
 
 
425 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.37 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.29 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1028  Fmu (Sun)  34.7 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  33.56 
 
 
434 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.69 
 
 
423 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  35.05 
 
 
519 aa  136  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  35.91 
 
 
428 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.05 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.54 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.92 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  32.04 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  35.46 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  27.51 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.91 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.71 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  33.43 
 
 
423 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.35 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1645  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase  34.59 
 
 
392 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000605846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  29.85 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.91 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.59 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.34 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.89 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  30.11 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  29.04 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  33.03 
 
 
437 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  31.15 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  32.93 
 
 
429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>