More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1575 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  100 
 
 		 486 aa  1008    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.72 
 
 		 453 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.27 
 
 		 463 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.28 
 
 		 453 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  74.62 
 
 		 463 aa  726    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  86.18 
 
 		 457 aa  819    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  85.59 
 
 		 457 aa  818    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  75.5 
 
 		 453 aa  717    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  86.72 
 
 		 469 aa  843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.71 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.68 
 
 		 458 aa  535  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  58.64 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.85 
 
 		 449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.5 
 
 		 460 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.43 
 
 		 475 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  50.11 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  30.61 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.33 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  30.84 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.84 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.84 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  30.13 
 
 		 466 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.16 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.16 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  29.25 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  29.25 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  29.25 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  29.25 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  29.48 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  29.48 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  29.48 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  29.48 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.39 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.42 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  29.35 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  31.19 
 
 		 519 aa  176  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  29.93 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  29.93 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  29.79 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  29.25 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.02 
 
 		 419 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.77 
 
 		 425 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  29.19 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  29 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  29.53 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  28.97 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  28.38 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  29.26 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  31.52 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  27.4 
 
 		 423 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  28.15 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.91 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.92 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.38 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  28.84 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.78 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.67 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.46 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  27.6 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.6 
 
 		 425 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.27 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.12 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  31.36 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  27.79 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  27.7 
 
 		 433 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.31 
 
 		 415 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  27.29 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  31.56 
 
 		 460 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.18 
 
 		 423 aa  143  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.59 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.43 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.39 
 
 		 446 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  27.57 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  26.95 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  29.09 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  30.45 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  30.45 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.41 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  31 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  32.18 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.14 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.57 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  30.94 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  31.14 
 
 		 429 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.2 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.93 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  29.68 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  27.36 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  27.25 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.65 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0343  NOL1/NOP2/sun family protein  36.36 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.1 
 
 		 452 aa  134  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  27.21 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  32.95 
 
 		 442 aa  133  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.58 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.72 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  30.94 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  27.47 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3160  Fmu (Sun) domain protein  28.03 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.87 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>