More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1086 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  100 
 
 		 454 aa  926    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.22 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.42 
 
 		 475 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.81 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  51.74 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.22 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.54 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.54 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  50.11 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.36 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.45 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.12 
 
 		 460 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  48.79 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.45 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.01 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.34 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.48 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  32.48 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  32.56 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.11 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.11 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  31.17 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  31.92 
 
 		 420 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.35 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  31.8 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.41 
 
 		 419 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  37.5 
 
 		 420 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  29.25 
 
 		 519 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  37.5 
 
 		 420 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  37.5 
 
 		 420 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  37.5 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  37.5 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  37.5 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  30.29 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.29 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.29 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  37.5 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.47 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  30.07 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  30.44 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  30.97 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.97 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  36.6 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  29.89 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.53 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  36.27 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  30.14 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.5 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  35.08 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  32.13 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  35.86 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.89 
 
 		 424 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.15 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  31.14 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  30.68 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.57 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.93 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.84 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0995  Fmu (Sun) domain protein  30.11 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  29.42 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  34.77 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.71 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.44 
 
 		 470 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.02 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.96 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  33.8 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  30.48 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.09 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  34.43 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.87 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.26 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  30.64 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6838  Fmu (Sun) domain protein  29.78 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  33.86 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  32.76 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.29 
 
 		 426 aa  136  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  35.13 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  38.05 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.62 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.9 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.99 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.65 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.67 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.7 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  29.64 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  26.76 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  30.53 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.25 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.17 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  31.42 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.62 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  28.25 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  34.28 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.31 
 
 		 404 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.54 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.39 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.39 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  41.13 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  29.93 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.53 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>