More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0995 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0995  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 387 aa  798    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6838  Fmu (Sun) domain protein  48.07 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3442  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.21 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1086  Fmu (Sun)  30.11 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.5 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2739  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.28 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438417  hitchhiker  0.0000842018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2867  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.5 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2697  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.5 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2960  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.84 
 
 		 449 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2643  Fmu (Sun)  29.84 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1376  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.6 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1209  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.77 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1575  NOL1/NOP2/sun family putative RNA methylase  26.43 
 
 		 486 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1415  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.6 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2967  Fmu (Sun) domain protein  26.25 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30363  normal  0.0477993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1392  Fmu (Sun) domain-containing protein  25.95 
 
 		 453 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3295  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.49 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1305  Fmu (Sun) domain-containing protein  25.17 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  28.17 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  28.17 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  28.4 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  28.4 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.75 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  27.91 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  26.9 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  28.69 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  29.67 
 
 		 429 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  29.67 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  29.67 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  31.58 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.64 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  33.93 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  29.48 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.73 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  34.73 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.5 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.5 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  34.5 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.73 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.33 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.13 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  25.55 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.13 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  27.47 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  27.11 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  27.11 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  27.11 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  27.11 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  27.11 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  27.47 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  27.11 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  35.29 
 
 		 453 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  29.2 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.49 
 
 		 488 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.47 
 
 		 429 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  29.67 
 
 		 431 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  28.51 
 
 		 447 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  27.23 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.43 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2091  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.02 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.28 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.84 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  27.11 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  31.89 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.84 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  32.34 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31.06 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  31.36 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  29.19 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  31.66 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  30.04 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3846  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.85 
 
 		 451 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  29.37 
 
 		 421 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.95 
 
 		 444 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  30.84 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  32.34 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  25.56 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  33.53 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.28 
 
 		 535 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.65 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  29.33 
 
 		 465 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  28.4 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  27.65 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  31.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.75 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  28.33 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  30.66 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  31.58 
 
 		 427 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  30.28 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.58 
 
 		 429 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  26.71 
 
 		 438 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.48 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  30.22 
 
 		 465 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>