102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9183 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  47.17 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.56 
 
 
489 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.29 
 
 
280 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.01 
 
 
279 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.28 
 
 
321 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.45 
 
 
304 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.67 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.59 
 
 
519 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  38.57 
 
 
287 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  33.75 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.01 
 
 
687 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  31.45 
 
 
394 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  31.45 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.71 
 
 
629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  36.47 
 
 
262 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.1 
 
 
499 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.32 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.72 
 
 
1967 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.11 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.47 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.25 
 
 
415 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.52 
 
 
574 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  26.03 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.16 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  26.81 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  25.62 
 
 
274 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.99 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  23.3 
 
 
569 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.17 
 
 
456 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  25.64 
 
 
676 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  24.15 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  26.86 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.52 
 
 
558 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  32.87 
 
 
505 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  23.83 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  28.24 
 
 
428 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  27.3 
 
 
676 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  25.17 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  24.55 
 
 
274 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  23.75 
 
 
417 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  31.91 
 
 
510 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51391  predicted protein  27.98 
 
 
645 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644512  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  22.49 
 
 
695 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  25.19 
 
 
269 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  26.12 
 
 
261 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  26.54 
 
 
525 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  29.86 
 
 
523 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0277  phosphopentomutase  27.81 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  22.42 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.23 
 
 
558 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  22.37 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 
507 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  23.34 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 
507 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  22.97 
 
 
678 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  26.76 
 
 
504 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  24.56 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.48 
 
 
496 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 
510 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  27.89 
 
 
512 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0249  phosphopentomutase  27.95 
 
 
398 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  29.79 
 
 
511 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.24 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  30.99 
 
 
518 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.48 
 
 
455 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.24 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.73 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1596  phosphopentomutase  27.95 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.76 
 
 
499 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  24.26 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  26.87 
 
 
516 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  23.94 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 
516 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  31.34 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  27.66 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.4 
 
 
411 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.49 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  29.59 
 
 
486 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.4 
 
 
268 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  29.75 
 
 
512 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  25.77 
 
 
706 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1756  sulfatase  24.68 
 
 
474 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  28.3 
 
 
516 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.12 
 
 
509 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  26.06 
 
 
512 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.7 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2472  phosphoglyceromutase  30.4 
 
 
528 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  30.66 
 
 
505 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.86 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0625  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.25 
 
 
681 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  27.24 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  22.93 
 
 
999 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  27.24 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  31.34 
 
 
509 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  26.57 
 
 
512 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  27.24 
 
 
471 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.28 
 
 
336 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>