55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1314 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 336 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.67 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.39 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.13 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  29.22 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.74 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66043  predicted protein  33.62 
 
 		 1009 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  36.64 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.52 
 
 		 558 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  27.08 
 
 		 569 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  26.56 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0653  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.35 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00732097  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.51 
 
 		 499 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  39.44 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.91 
 
 		 499 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  25.31 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.13 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  30.84 
 
 		 523 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  34.68 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.43 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.9 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  34.82 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.83 
 
 		 496 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  24.03 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.12 
 
 		 455 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  36.07 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  35.04 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.45 
 
 		 534 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  25.85 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  32.38 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.92 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  37.23 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  28.88 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  35.25 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  35.25 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  35.25 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  35.25 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  35.25 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  34.19 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  31.88 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  37.23 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  24.23 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  34.23 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  29.25 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  35.62 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  25.21 
 
 		 417 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  34.71 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24.07 
 
 		 713 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  26.74 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.03 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.41 
 
 		 447 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  30.28 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.35 
 
 		 413 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  34.62 
 
 		 404 aa  42.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>