83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0170 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  800    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.7 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  44.78 
 
 		 393 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.67 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.59 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.06 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.37 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.58 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.86 
 
 		 412 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.66 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.82 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.9 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.53 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.65 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  27.3 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.3 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.3 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.25 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  29.89 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.53 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  30.58 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.46 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  30.75 
 
 		 379 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.02 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.97 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  32.77 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.44 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  30.49 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.28 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  30.53 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.07 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.73 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.64 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  29.52 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.14 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.72 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.38 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.32 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1414  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.57 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  27.85 
 
 		 254 aa  97.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.44 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2738  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.15 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310844  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2694  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.15 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.78 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.12 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.5 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.28 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243373  normal  0.467726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.43 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.13 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.899257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.63 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  26.04 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1198  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.15 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0227  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.43 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.96 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.9 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  26.11 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.36 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.55 
 
 		 455 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  25.48 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0329  sulfatase  41.18 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.55 
 
 		 713 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  22.94 
 
 		 540 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.03 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.78 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.34 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0593  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.59 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.69 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2123  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0845  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.3 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  25.11 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  26.05 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.62 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.91 
 
 		 565 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.53 
 
 		 489 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.07 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  32.84 
 
 		 545 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  21.97 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.1 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 		 467 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.82 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  32.84 
 
 		 545 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  21.05 
 
 		 556 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>