77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1696 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
393 aa  761    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  58.82 
 
 
409 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  60.27 
 
 
393 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.03 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.34 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  47.06 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.44 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.53 
 
 
396 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.07 
 
 
372 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1414  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.16 
 
 
395 aa  250  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.36 
 
 
412 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.7 
 
 
412 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.88 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.66 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.24 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.18 
 
 
412 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.19 
 
 
391 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  42.11 
 
 
393 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  41.32 
 
 
391 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.94 
 
 
386 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.74 
 
 
391 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2738  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.51 
 
 
378 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310844  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2694  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.51 
 
 
378 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.98 
 
 
378 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243373  normal  0.467726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  40.99 
 
 
371 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.57 
 
 
414 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  41.13 
 
 
379 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  38.28 
 
 
419 aa  202  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.95 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.2 
 
 
389 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.96 
 
 
377 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.56 
 
 
397 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  38.84 
 
 
377 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.27 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.26 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  31.23 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.75 
 
 
387 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.32 
 
 
412 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.8 
 
 
369 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  30.3 
 
 
393 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.97 
 
 
423 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.899257  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1198  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.47 
 
 
374 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.18 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.41 
 
 
395 aa  93.6  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.83 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.29 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.65 
 
 
470 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  24.64 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.64 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  24.08 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  33.6 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.41 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  26.53 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  27.33 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.88 
 
 
262 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  30.52 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  30.52 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  25.33 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  29.87 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  27.31 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  29.87 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  29.87 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  29.87 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  29.87 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.32 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  24.26 
 
 
413 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  29.87 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0845  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.11 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  30.52 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.2 
 
 
519 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  30.52 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  32.56 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  25.85 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0333  metalloenzyme domain protein  23 
 
 
515 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134718  normal  0.059537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  29.38 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  41.79 
 
 
428 aa  42.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>