77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1930 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 409 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  59.15 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  58.82 
 
 		 393 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.42 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  47.45 
 
 		 415 aa  321  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.72 
 
 		 419 aa  290  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  46.09 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1414  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.53 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.17 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.42 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.8 
 
 		 416 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.69 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.75 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.22 
 
 		 412 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.26 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.23 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  40.44 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  39.95 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.72 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.23 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.97 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  38.33 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.02 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  38.46 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.68 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2738  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.6 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310844  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2694  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.6 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.1 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.95 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243373  normal  0.467726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.6 
 
 		 377 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.79 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.77 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  35.37 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  36.46 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.69 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.95 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  31.28 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.23 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.3 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  31.96 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.9 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.899257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.05 
 
 		 386 aa  97.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.13 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1198  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.02 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.39 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.47 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  23.16 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.16 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.45 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.37 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.97 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0227  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.9 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  21.67 
 
 		 254 aa  53.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  30.3 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  27.78 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  26.98 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  27.5 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  26.32 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  28.77 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  30.99 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  39.68 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  33.33 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  30 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  26.09 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  29.84 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  30.5 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.88 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  33.91 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.97 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  28.95 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  27.69 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  26.56 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  25.15 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  25.9 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  25.9 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  25.9 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>