212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2847 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  100 
 
 
391 aa  797    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  57.22 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  56.44 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  55.9 
 
 
389 aa  438  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  58.25 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  56.19 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  56.3 
 
 
389 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  54.24 
 
 
394 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  51.41 
 
 
392 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  56.58 
 
 
396 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  58.14 
 
 
349 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  54.57 
 
 
396 aa  420  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  51.03 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  51.03 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  51.04 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  53.91 
 
 
390 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  50.26 
 
 
394 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  50.51 
 
 
394 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  53.35 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  50.51 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  51.16 
 
 
393 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  48.85 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  51.02 
 
 
420 aa  398  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  50.8 
 
 
392 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  53.08 
 
 
390 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  51.03 
 
 
393 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  49.36 
 
 
391 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  50.91 
 
 
390 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  51.17 
 
 
390 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  47.56 
 
 
390 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  50.77 
 
 
388 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  51.03 
 
 
388 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  50.52 
 
 
391 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  50.39 
 
 
392 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  50.38 
 
 
389 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  46.43 
 
 
392 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  46.43 
 
 
392 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  45.24 
 
 
396 aa  354  1e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  44.81 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  46.21 
 
 
409 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  44.85 
 
 
396 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  45.41 
 
 
404 aa  339  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  44.85 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  46.58 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  47.06 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  46.32 
 
 
406 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  49.34 
 
 
392 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  46.06 
 
 
397 aa  331  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  45.59 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  45.81 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  43.38 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  43.13 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  46.07 
 
 
386 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  46.59 
 
 
407 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  46.1 
 
 
407 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  43.25 
 
 
403 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  43.25 
 
 
403 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  43.38 
 
 
407 aa  315  8e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  43.38 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  43.14 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  44.04 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  43.38 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  45.4 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  43.38 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  45.98 
 
 
406 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  42.89 
 
 
407 aa  311  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  42.12 
 
 
403 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  44.33 
 
 
405 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  44.83 
 
 
404 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  44.83 
 
 
404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  44.83 
 
 
404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  42.65 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  43.35 
 
 
405 aa  309  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  44.23 
 
 
405 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  43.38 
 
 
407 aa  308  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  45.07 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0829  phosphopentomutase  46.15 
 
 
418 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  42.65 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  42.65 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  44.09 
 
 
404 aa  306  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  44.33 
 
 
404 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  41.13 
 
 
411 aa  305  7e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  45.73 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  43.61 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  42.89 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  45.48 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>