147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0905 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  100 
 
 
391 aa  779    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  96.63 
 
 
388 aa  745    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  96.64 
 
 
388 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  81.35 
 
 
389 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  56.59 
 
 
390 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  56.74 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  53.75 
 
 
397 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  52.96 
 
 
394 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  56.69 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  54.01 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  54.62 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  54.26 
 
 
388 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  55.1 
 
 
420 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  58.58 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  55.32 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  58.38 
 
 
397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  51.02 
 
 
392 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  54.81 
 
 
390 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  52.21 
 
 
392 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  55.27 
 
 
390 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  51.03 
 
 
390 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  50.38 
 
 
393 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  48.97 
 
 
392 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  48.35 
 
 
393 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  50.52 
 
 
391 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  46.8 
 
 
394 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  46.8 
 
 
394 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  46.21 
 
 
395 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  46.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  49.49 
 
 
390 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  46.29 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  50.54 
 
 
392 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  52.33 
 
 
349 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  52.01 
 
 
381 aa  364  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  52.28 
 
 
386 aa  363  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  49.37 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  49.62 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  43.12 
 
 
385 aa  352  8.999999999999999e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  54.21 
 
 
392 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  45.52 
 
 
391 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  51.78 
 
 
392 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  46.53 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  45.79 
 
 
407 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  46.15 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  47.52 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  44.82 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  44.56 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  43.51 
 
 
392 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  43.51 
 
 
392 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  46.93 
 
 
404 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  45.2 
 
 
397 aa  333  4e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  46.93 
 
 
404 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  46.65 
 
 
404 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  45.06 
 
 
397 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  45.81 
 
 
405 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  46.68 
 
 
404 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  46.68 
 
 
404 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  48.13 
 
 
409 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  46.72 
 
 
407 aa  328  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  47.03 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  45.66 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  46.46 
 
 
407 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  46.46 
 
 
407 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  42.75 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  46.95 
 
 
406 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  45.91 
 
 
407 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  46.21 
 
 
407 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  47.42 
 
 
404 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  47.04 
 
 
405 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  46.68 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  46.93 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  46.17 
 
 
413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  47.65 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  46.93 
 
 
404 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  48.98 
 
 
406 aa  319  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  46.97 
 
 
407 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  46.79 
 
 
384 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  44.8 
 
 
406 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  44.83 
 
 
407 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  46.46 
 
 
407 aa  316  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2813  phosphopentomutase  47.67 
 
 
405 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00335296  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  44.2 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  48.22 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  44.83 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  45.68 
 
 
406 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  44.77 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  45.23 
 
 
407 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  45.96 
 
 
407 aa  308  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  45.96 
 
 
407 aa  308  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>