141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2320 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  100 
 
 		 392 aa  796    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  54.96 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  53.87 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  50.9 
 
 		 390 aa  411  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  51.68 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  52.84 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  53.81 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  54.12 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  52.2 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  53.69 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  53.63 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  51.3 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  49.87 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  54.83 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  51.03 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  53.75 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  52.21 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  52.47 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  52.21 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  52.79 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  48.09 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  50.78 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  49.11 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  47.33 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  48.09 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  47.33 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  47.58 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  47.58 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  47.58 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  47.58 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  50.26 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  47.58 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  50.52 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  47.58 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  51.93 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  50.39 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  47.43 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  48.44 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  46.04 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  44.99 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  47.84 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  50 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  45.01 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  45.01 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  45.76 
 
 		 390 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  46.95 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  43.94 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  43.94 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  47.67 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  47.96 
 
 		 406 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  48.21 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  48.11 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  45.54 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  46.67 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  47.18 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  46.23 
 
 		 409 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  47.72 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  44.69 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  44.58 
 
 		 415 aa  318  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  45.37 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  46.81 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  44.39 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  45.79 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  45.37 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  47.85 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  45.12 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  45.37 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  45.37 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  46.19 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  47.06 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  43.38 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  45.48 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  43.38 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  45.59 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  43.47 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1570  phosphopentomutase  47.3 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  47.25 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  42.37 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  43.73 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  44.53 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  45 
 
 		 407 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  44.47 
 
 		 406 aa  308  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  44.92 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  45 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  45.59 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  45 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  46.26 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  44.89 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  44.97 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  44.61 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  44.72 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  44.72 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>