142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0781 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  97.95 
 
 		 390 aa  781    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  100 
 
 		 390 aa  795    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  61.88 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  63.21 
 
 		 390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  60.82 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  60.72 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  60.05 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  60.31 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  58.35 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  60.05 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  61.1 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  57.99 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  57.96 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  57.44 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  58.29 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  55.96 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  55.7 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  55.7 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  55.7 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  58.51 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  56.51 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  57.55 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  56.92 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  54.2 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  56.66 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  55.09 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  57.49 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  56.98 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  53.42 
 
 		 385 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  55.06 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  54.81 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  54.81 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  55.15 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  52.48 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  52.48 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  52.85 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  50.52 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  50.91 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  50.13 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  52.2 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  49.74 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  48.97 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  50.52 
 
 		 381 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  48.14 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  48.14 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  49.5 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  49.1 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  47.54 
 
 		 407 aa  336  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  45.3 
 
 		 404 aa  335  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  47.04 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  47.86 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  47.99 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  47.99 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  47.28 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  47.28 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  46.94 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  47.03 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  47.03 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  46.94 
 
 		 407 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  46.04 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  46.94 
 
 		 407 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  46.78 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  46.15 
 
 		 407 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  46.53 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  47.03 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  46.29 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  46.31 
 
 		 406 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  45.68 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  47.77 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  47.77 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  45.54 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  46.06 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  47.52 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  45.27 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  47.52 
 
 		 404 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  44.83 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  44.09 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  44.84 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  44.83 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  45.57 
 
 		 405 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  44.06 
 
 		 411 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  45.48 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  45.48 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 406 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  45.21 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>