188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06950 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  100 
 
 		 349 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  65.33 
 
 		 389 aa  484  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  63.85 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  62.36 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  64.14 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  59.2 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  58.74 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  57.39 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  59.3 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  58.14 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  59.46 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  57.18 
 
 		 392 aa  418  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  57.18 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  56.73 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  57.55 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  56.98 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  54.29 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  55.1 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  55.14 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  381  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  52.03 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  52.17 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  51.01 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  53.2 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  51.3 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  53.07 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  51.59 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  53.6 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  52.33 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  52.91 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  52.8 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  52.33 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  52.33 
 
 		 391 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  52.6 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  48.67 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  50 
 
 		 392 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  54.02 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  48.1 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  48.1 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  47.66 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  48.85 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  50 
 
 		 381 aa  335  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  47.44 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  46.84 
 
 		 392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  47.97 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  46.59 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  46.59 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  46.46 
 
 		 411 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  47.04 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  49.01 
 
 		 406 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  49.3 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  50.31 
 
 		 407 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  49.39 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  46.15 
 
 		 396 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  46.15 
 
 		 396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  47.08 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  47.52 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  48.17 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  46.63 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  47.32 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  46.48 
 
 		 406 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  46.76 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  45.94 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  46.63 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  47.22 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  46.63 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  45.94 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  46.63 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  45.94 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  47.19 
 
 		 404 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  46.05 
 
 		 407 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  46.39 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  46.39 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  46.39 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  46.07 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  45.48 
 
 		 404 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  45.79 
 
 		 407 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  45.79 
 
 		 407 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  45.38 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  44.79 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  44.38 
 
 		 406 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  47.22 
 
 		 404 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  44.35 
 
 		 415 aa  295  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  48.61 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2813  phosphopentomutase  49.4 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00335296  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  45.68 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  45.68 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  47.22 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>