153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3205 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  100 
 
 
392 aa  806    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  62.79 
 
 
389 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  59.08 
 
 
397 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  59.79 
 
 
388 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  60.1 
 
 
388 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  58.35 
 
 
394 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  58.52 
 
 
389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  58.91 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  58.06 
 
 
397 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  56.49 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  55.04 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  54.85 
 
 
397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  57.7 
 
 
390 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  54.06 
 
 
394 aa  441  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  57.96 
 
 
390 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  53.81 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  53.81 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  54.34 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  53.81 
 
 
395 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  58.74 
 
 
349 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  53.55 
 
 
394 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  51.41 
 
 
391 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  53.63 
 
 
393 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  54.91 
 
 
392 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  54.21 
 
 
396 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  54.08 
 
 
390 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  54.06 
 
 
396 aa  421  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  51.9 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  51.29 
 
 
392 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  51.29 
 
 
392 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  51.04 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  51.02 
 
 
391 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  51.29 
 
 
388 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  49.74 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  49.87 
 
 
392 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  50.77 
 
 
388 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  52.58 
 
 
389 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  51.16 
 
 
390 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  48.23 
 
 
385 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  49.87 
 
 
392 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  49.36 
 
 
397 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  51.31 
 
 
381 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  50.79 
 
 
386 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  47.41 
 
 
403 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  47.41 
 
 
403 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  47.9 
 
 
403 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  46.83 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  45.7 
 
 
411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  46.83 
 
 
396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  49.04 
 
 
392 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  48.51 
 
 
404 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  47.43 
 
 
407 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  45.34 
 
 
405 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  47.92 
 
 
407 aa  342  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  46.83 
 
 
407 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  46.32 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  45.7 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  46.83 
 
 
407 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  46.83 
 
 
407 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  47.68 
 
 
407 aa  338  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  45.32 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  45.83 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  45.83 
 
 
404 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  45.83 
 
 
404 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  46 
 
 
407 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  47.22 
 
 
407 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  45.26 
 
 
406 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  45.72 
 
 
407 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  45.32 
 
 
406 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  45.75 
 
 
397 aa  333  4e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  45.63 
 
 
406 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  44.58 
 
 
406 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  44.85 
 
 
406 aa  332  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  45.85 
 
 
406 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  46.1 
 
 
407 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  46.1 
 
 
407 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  46.32 
 
 
407 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  45.18 
 
 
406 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  44.15 
 
 
405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  46.6 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  46.6 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  46.6 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  46.6 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  45.83 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  44.99 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  45.26 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  46.6 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  45.32 
 
 
407 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>