146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2446 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  100 
 
 
401 aa  825    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  48.48 
 
 
388 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  49.37 
 
 
391 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  49.62 
 
 
388 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  49.37 
 
 
388 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  47.28 
 
 
392 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  47.72 
 
 
397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  48.21 
 
 
396 aa  355  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  46.97 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  47.19 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  46.87 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  46.41 
 
 
390 aa  348  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  48.23 
 
 
397 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  47.07 
 
 
388 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  46.68 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  48.21 
 
 
392 aa  338  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  47.18 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  46.19 
 
 
395 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  46.04 
 
 
392 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  45.69 
 
 
394 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  47.31 
 
 
397 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  45.69 
 
 
394 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  44.5 
 
 
394 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  46.58 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  45.43 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  47.68 
 
 
393 aa  325  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  44.89 
 
 
420 aa  325  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  44.84 
 
 
390 aa  323  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  44.58 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  44 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  43.04 
 
 
391 aa  311  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  43.3 
 
 
386 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  42.2 
 
 
381 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  43.84 
 
 
385 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  43.61 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  41.65 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  44.27 
 
 
392 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  45.7 
 
 
396 aa  299  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  44.64 
 
 
390 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  43.4 
 
 
392 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  43.4 
 
 
392 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  43.78 
 
 
392 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  42.28 
 
 
396 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  42.28 
 
 
396 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  44.29 
 
 
396 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  45.37 
 
 
349 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  43.67 
 
 
397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  41.45 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  40.96 
 
 
407 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  40.96 
 
 
407 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  41.83 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  41.15 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  40.57 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  41.46 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  41.69 
 
 
407 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  40.48 
 
 
407 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  40.57 
 
 
406 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  40.81 
 
 
415 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  41.28 
 
 
404 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  279  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  41.03 
 
 
404 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  41.55 
 
 
407 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  41.55 
 
 
407 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  41.25 
 
 
406 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  41.03 
 
 
404 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  41.03 
 
 
404 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  40 
 
 
405 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  40.79 
 
 
404 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  40.48 
 
 
407 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  41.16 
 
 
407 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  40.58 
 
 
407 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  40.24 
 
 
407 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  39.66 
 
 
406 aa  275  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  40.82 
 
 
407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  40.19 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  41.28 
 
 
384 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  39.71 
 
 
406 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  40.58 
 
 
407 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  40.58 
 
 
407 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  40.58 
 
 
407 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  40.58 
 
 
407 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  40.1 
 
 
407 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  42.28 
 
 
409 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  40.1 
 
 
406 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  40.58 
 
 
407 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  41.4 
 
 
405 aa  269  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  40.05 
 
 
403 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  40.55 
 
 
403 aa  266  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>