157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1001 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  100 
 
 		 411 aa  842    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  69.93 
 
 		 403 aa  588  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  66.99 
 
 		 403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  66.99 
 
 		 403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  55.37 
 
 		 394 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  55.37 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  55.61 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  55.37 
 
 		 394 aa  431  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  55.37 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  55.37 
 
 		 394 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  55.12 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  55.12 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  55.37 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  55.12 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  53.88 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  54.74 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  54.74 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  54 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  53.77 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  51.57 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  52.94 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  48.41 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  45.7 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  45.34 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  45.65 
 
 		 396 aa  348  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  45.65 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  46.39 
 
 		 385 aa  342  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  48.16 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  45.7 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  45.57 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  44.72 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  45.45 
 
 		 388 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  43.46 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  44.55 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  43.87 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  43.51 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  46.46 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  45.81 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  44.62 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  42.05 
 
 		 392 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  44.06 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  44.06 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  42.37 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  43.24 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  41.13 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  42.18 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  42.65 
 
 		 392 aa  299  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf033  phosphopentomutase  39.42 
 
 		 396 aa  299  6e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  39.45 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  39.69 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  38.81 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  38.81 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  40.15 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  38.81 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  38.6 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  39.68 
 
 		 407 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  39.7 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  39.29 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  39.29 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  38.52 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  39.29 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  39.05 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  39.01 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  39.86 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  39.91 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  39.91 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  39.91 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  39.91 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  39.86 
 
 		 415 aa  269  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  39.68 
 
 		 407 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  40.33 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  39.82 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  38.99 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  39.13 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  39.13 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  40.09 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  39.04 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  40.56 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  38.08 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  39.45 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  39.45 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  38.59 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  39.62 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  39.38 
 
 		 407 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  39.81 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  38.82 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  38.44 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  38.23 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  38.95 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  38.06 
 
 		 405 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0249  phosphopentomutase  38.48 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>