139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0150 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  100 
 
 		 381 aa  778    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  83.2 
 
 		 386 aa  660    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  61.7 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  51.47 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  51.58 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  51.31 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  52.3 
 
 		 389 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  52.3 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  50 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  50 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  52.01 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  51.86 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  52.01 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  51.6 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  48.17 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  52.13 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  48.94 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  49.06 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  47.52 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  47.8 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  47.91 
 
 		 391 aa  348  9e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  48.09 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  50.52 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  47.55 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  50 
 
 		 390 aa  345  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  47.35 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  46.09 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  45.83 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  49.6 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  47.84 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  47.89 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  50 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  51.21 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  47.72 
 
 		 390 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  45.81 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  49.09 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  45.6 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  45.6 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  45.26 
 
 		 396 aa  322  7e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  44.56 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  44.89 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  47.06 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  43.9 
 
 		 403 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  44.42 
 
 		 397 aa  302  7.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  43.64 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  43.64 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  43.69 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  43.94 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  42.2 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  43.54 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  44.28 
 
 		 406 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  44.72 
 
 		 407 aa  292  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  44.72 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  44.72 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  43.04 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  43.54 
 
 		 407 aa  288  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  43.29 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  44.86 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  42.53 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  42.53 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  42.53 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  44.89 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  45.11 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  41.69 
 
 		 406 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  44.22 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  39.69 
 
 		 411 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  45.04 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  42.46 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  43.15 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  42.46 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  42.53 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  43.54 
 
 		 404 aa  279  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  43.56 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  41.77 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  41.67 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  41.07 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  42.09 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  42.78 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  43.04 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  42.09 
 
 		 407 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  42.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  42.78 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>