142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4925 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  93.37 
 
 
407 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  93.37 
 
 
407 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  84.77 
 
 
407 aa  716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  82.56 
 
 
407 aa  703    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  99.75 
 
 
407 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  94.84 
 
 
407 aa  806    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  76.47 
 
 
406 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  83.54 
 
 
407 aa  709    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  84.52 
 
 
407 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  75.49 
 
 
406 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  86.73 
 
 
407 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  75 
 
 
406 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  85.75 
 
 
407 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  86.24 
 
 
407 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  86.73 
 
 
407 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  93.61 
 
 
407 aa  794    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  100 
 
 
407 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  100 
 
 
407 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  100 
 
 
407 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  100 
 
 
407 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  75.25 
 
 
406 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  71.01 
 
 
404 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  70.52 
 
 
404 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  70.52 
 
 
404 aa  594  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  69.04 
 
 
405 aa  594  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  70.52 
 
 
404 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  70.52 
 
 
404 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  69.53 
 
 
405 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  68.3 
 
 
405 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  70.76 
 
 
404 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  69.04 
 
 
407 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  70.27 
 
 
405 aa  577  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  70.27 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  70.02 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  70.02 
 
 
404 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2813  phosphopentomutase  69.29 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00335296  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  62.83 
 
 
415 aa  558  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1027  phosphopentomutase  67.57 
 
 
405 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0829  phosphopentomutase  62.04 
 
 
418 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  57.46 
 
 
406 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  55.99 
 
 
406 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  56.72 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  55.26 
 
 
406 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  56.86 
 
 
407 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  57.11 
 
 
407 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  54.55 
 
 
413 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  55.53 
 
 
404 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  55.12 
 
 
397 aa  448  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  55.5 
 
 
409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  54.79 
 
 
406 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  54.3 
 
 
405 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  53.07 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  53.35 
 
 
407 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  52.12 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  51.59 
 
 
405 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  50.61 
 
 
402 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0277  phosphopentomutase  50 
 
 
398 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0249  phosphopentomutase  48.28 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1596  phosphopentomutase  48.28 
 
 
398 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1570  phosphopentomutase  46.36 
 
 
404 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  48.78 
 
 
388 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0829  phosphopentomutase  46.44 
 
 
399 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.654335  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  47.04 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  46.37 
 
 
397 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  46.84 
 
 
395 aa  338  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  47.07 
 
 
389 aa  338  9e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  46.36 
 
 
394 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  46.36 
 
 
394 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  46.36 
 
 
394 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  46.36 
 
 
394 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  46.36 
 
 
394 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  46.12 
 
 
394 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  46.12 
 
 
394 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  46.12 
 
 
394 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  46.12 
 
 
394 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  45.99 
 
 
393 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  47.19 
 
 
420 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  47.25 
 
 
389 aa  328  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  46.6 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  45.63 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  45.26 
 
 
393 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  48.47 
 
 
397 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  46.97 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  46.97 
 
 
396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  45.39 
 
 
394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  45.74 
 
 
388 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  45.94 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  44.99 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  45.23 
 
 
390 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  45.23 
 
 
391 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  44.74 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  46.08 
 
 
396 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  44.5 
 
 
388 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  45.11 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>