141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1281 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  100 
 
 
397 aa  782    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  65.34 
 
 
396 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  62.11 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  61.44 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  61.66 
 
 
389 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  63.92 
 
 
389 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  60.67 
 
 
397 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  59.41 
 
 
394 aa  475  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  57.62 
 
 
390 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  58.51 
 
 
388 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  57.11 
 
 
392 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  57.7 
 
 
390 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  57.44 
 
 
390 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  54.85 
 
 
392 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  57.55 
 
 
390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  58.25 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  54.26 
 
 
393 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  59.46 
 
 
349 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  51.28 
 
 
395 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  56.81 
 
 
420 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  51.99 
 
 
392 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  50.77 
 
 
394 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  54.52 
 
 
393 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  59.16 
 
 
388 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  50.26 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  58.9 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  58.38 
 
 
391 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  49.23 
 
 
391 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  51.52 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  56.44 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  50.13 
 
 
385 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  50.27 
 
 
390 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  55.47 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  53.75 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  47.81 
 
 
396 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  47.81 
 
 
392 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  47.81 
 
 
392 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  57.83 
 
 
392 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  52.04 
 
 
392 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  53.19 
 
 
386 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  52.13 
 
 
381 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  44.82 
 
 
396 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  44.82 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  45.52 
 
 
397 aa  351  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  51.21 
 
 
384 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  48.23 
 
 
401 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  44.72 
 
 
403 aa  333  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  44.83 
 
 
403 aa  329  6e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  44.83 
 
 
403 aa  329  6e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  44.69 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  44.2 
 
 
407 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  47.72 
 
 
404 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  47.46 
 
 
404 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  47.46 
 
 
404 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  47.46 
 
 
404 aa  322  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  47.21 
 
 
404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  50.63 
 
 
406 aa  319  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  49.87 
 
 
406 aa  318  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  43 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  49.87 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  45 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  44.01 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  45.69 
 
 
405 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  45.69 
 
 
405 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  49.75 
 
 
407 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  47.3 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  44.11 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  44.11 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  49.26 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  47.74 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  44.86 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  45.43 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  43.86 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  44.33 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  47.46 
 
 
404 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  45.94 
 
 
405 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  47.46 
 
 
404 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  47.46 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  47.21 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  47.42 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  43.47 
 
 
407 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  46.15 
 
 
409 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  44.22 
 
 
407 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  48.05 
 
 
405 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  41.79 
 
 
415 aa  298  9e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  44.47 
 
 
407 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  43.22 
 
 
407 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  43.22 
 
 
407 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  43.22 
 
 
407 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  43.22 
 
 
407 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  43.22 
 
 
407 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  43.22 
 
 
407 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>