56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1517 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 369 aa  766    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.28 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  26.53 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.15 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.52 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  26.01 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.86 
 
 		 403 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.25 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.71 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  23.16 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.42 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.11 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.3 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.27 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.32 
 
 		 412 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.38 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.19 
 
 		 412 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.19 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.8 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.44 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  24.03 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  23.21 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.39 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.14 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.04 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.21 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.37 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  23.77 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.96 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.44 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.29 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.16 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  26.78 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.98 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  24.15 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.49 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.19 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.08 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0227  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.88 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.76 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.16 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  20.29 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.6 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243373  normal  0.467726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0593  hypothetical protein  37.59 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  22.93 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.16 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.899257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0845  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.33 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.07 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2738  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.08 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310844  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2694  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.08 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  25.25 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1414  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.28 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  21.01 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  23.83 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.5 
 
 		 713 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>