94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4133 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
377 aa  747    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.4 
 
 
393 aa  308  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.81 
 
 
385 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.07 
 
 
372 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.58 
 
 
409 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  47.61 
 
 
393 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.71 
 
 
412 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.58 
 
 
416 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.5 
 
 
382 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.26 
 
 
396 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.64 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.36 
 
 
412 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.41 
 
 
391 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  41.6 
 
 
415 aa  246  6.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  41.22 
 
 
393 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  41.64 
 
 
391 aa  235  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  40.11 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.42 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.84 
 
 
389 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.31 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.06 
 
 
414 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1414  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.18 
 
 
395 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.73 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.14 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.26 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2738  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.4 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310844  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  40.21 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2694  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.4 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.4 
 
 
378 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243373  normal  0.467726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.73 
 
 
377 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.68 
 
 
377 aa  205  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  40.92 
 
 
377 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.82 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  36.75 
 
 
419 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1198  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.03 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  29.1 
 
 
402 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.09 
 
 
387 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.85 
 
 
386 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.97 
 
 
386 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.09 
 
 
423 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.899257  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  31.99 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.81 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  25.56 
 
 
381 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.56 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.1 
 
 
470 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.73 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.52 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  24.28 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.19 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.78 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.13 
 
 
363 aa  56.6  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.29 
 
 
412 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.73 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  25.62 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  25.62 
 
 
412 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  29.46 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  25.62 
 
 
471 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  27.27 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  32.48 
 
 
420 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  26.79 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  29.05 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  36.13 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  41.18 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  28.94 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  35.29 
 
 
388 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  26.81 
 
 
411 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  26.83 
 
 
713 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  35.29 
 
 
388 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  43.66 
 
 
428 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  39.66 
 
 
268 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  32.48 
 
 
396 aa  46.2  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.87 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  35.34 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.59 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.57 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  25.95 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  24.88 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  33.33 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0333  metalloenzyme domain protein  24.42 
 
 
515 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134718  normal  0.059537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  37.1 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0593  hypothetical protein  30.59 
 
 
128 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  33.8 
 
 
501 aa  43.9  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  35.71 
 
 
274 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  35.71 
 
 
274 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.32 
 
 
273 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.5 
 
 
268 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.06 
 
 
278 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  26.17 
 
 
428 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.71 
 
 
268 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  38.24 
 
 
268 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  38.71 
 
 
269 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  35.94 
 
 
265 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.58 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>