44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1874 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  97.39 
 
 
269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  74.53 
 
 
287 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  73.78 
 
 
268 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  73.78 
 
 
268 aa  417  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  72.76 
 
 
291 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  74.16 
 
 
268 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.03 
 
 
278 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.03 
 
 
273 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.03 
 
 
268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  75 
 
 
265 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  69.32 
 
 
274 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  69.58 
 
 
274 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  61.31 
 
 
274 aa  346  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  61.3 
 
 
268 aa  332  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  61.19 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  52.45 
 
 
268 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  53.03 
 
 
267 aa  286  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  52.08 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  50.4 
 
 
261 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  38.03 
 
 
265 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  33.58 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.09 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.95 
 
 
478 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.77 
 
 
558 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.76 
 
 
499 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.64 
 
 
499 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.52 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.3 
 
 
496 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.22 
 
 
431 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  30.87 
 
 
428 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.52 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.31 
 
 
431 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  26.98 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.19 
 
 
422 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.49 
 
 
312 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.79 
 
 
437 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  24.79 
 
 
466 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.67 
 
 
417 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.84 
 
 
713 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.27 
 
 
416 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.71 
 
 
377 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  22.35 
 
 
350 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.78 
 
 
412 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>