55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4487 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  547  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  78.2 
 
 
274 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  76.98 
 
 
274 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  74.52 
 
 
268 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  75.76 
 
 
269 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  72.73 
 
 
287 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  71.59 
 
 
268 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  75 
 
 
269 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  70.94 
 
 
291 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.7 
 
 
278 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  70.08 
 
 
268 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.7 
 
 
268 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.7 
 
 
273 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  64.98 
 
 
268 aa  358  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  62.22 
 
 
274 aa  351  8.999999999999999e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.4 
 
 
282 aa  319  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  51.56 
 
 
268 aa  289  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  51.14 
 
 
267 aa  289  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  51.17 
 
 
268 aa  286  2e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  46.48 
 
 
261 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  36.4 
 
 
278 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  37.89 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.82 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  26.25 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.23 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.02 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.4 
 
 
499 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.62 
 
 
478 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.78 
 
 
312 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.77 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.62 
 
 
413 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  25.46 
 
 
466 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.72 
 
 
489 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.74 
 
 
531 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.44 
 
 
422 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06589  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04290)  33.33 
 
 
1067 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0901607  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24.68 
 
 
713 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.17 
 
 
496 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.4 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07049  GPI ethanolamine phosphate transferase 1 (EC 2.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXD1]  31.68 
 
 
930 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.350863  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  28.12 
 
 
999 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.88 
 
 
456 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47390  predicted protein  32.14 
 
 
668 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66043  predicted protein  29.29 
 
 
1009 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  27.65 
 
 
428 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  24.88 
 
 
417 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5730  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.11 
 
 
349 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.94 
 
 
377 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  26.34 
 
 
377 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  23.18 
 
 
400 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  26.97 
 
 
413 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 
433 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.16 
 
 
1967 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22 
 
 
629 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>