41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3162 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 282 aa  591  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  63.87 
 
 		 274 aa  356  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  63.43 
 
 		 268 aa  348  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  60.07 
 
 		 287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  61.6 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.33 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.33 
 
 		 268 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  58.96 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  58.96 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  59.7 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  57.46 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  61.19 
 
 		 269 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  57.36 
 
 		 274 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  57.84 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  59.7 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  59.4 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  51.31 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  45.49 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  45.11 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  45.08 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  32.55 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.47 
 
 		 499 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.84 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.03 
 
 		 558 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.63 
 
 		 499 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.53 
 
 		 422 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.12 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86507  major facilitator superfamily involved in the attachment of glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchors to proteins  23.41 
 
 		 901 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0578339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.01 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.61 
 
 		 433 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.05 
 
 		 478 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.77 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.67 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.14 
 
 		 1967 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.22 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  22.71 
 
 		 428 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  24 
 
 		 531 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.66 
 
 		 417 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.91 
 
 		 489 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>