46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1104 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  550  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  56.93 
 
 
268 aa  298  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  56.93 
 
 
268 aa  295  5e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  51.7 
 
 
274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  50.57 
 
 
274 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  51.7 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.19 
 
 
273 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.19 
 
 
268 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.19 
 
 
278 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  50 
 
 
287 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  50.92 
 
 
274 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.57 
 
 
268 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  50.38 
 
 
268 aa  279  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  53.41 
 
 
269 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  49.62 
 
 
268 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  53.03 
 
 
269 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  51.14 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  49.24 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.31 
 
 
282 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  36.26 
 
 
261 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  31.65 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.32 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.26 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.21 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86507  major facilitator superfamily involved in the attachment of glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchors to proteins  24.6 
 
 
901 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0578339 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06589  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04290)  25.56 
 
 
1067 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0901607  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47390  predicted protein  32.93 
 
 
668 aa  49.3  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  25.33 
 
 
400 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.13 
 
 
499 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.84 
 
 
417 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.92 
 
 
456 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.48 
 
 
489 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  37.21 
 
 
428 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.4 
 
 
478 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  26.78 
 
 
424 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.05 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.61 
 
 
713 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  24.44 
 
 
447 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26 
 
 
1967 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.6 
 
 
499 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  35.85 
 
 
377 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  22.36 
 
 
531 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02580  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative  23.08 
 
 
1037 aa  42.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  21.86 
 
 
350 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06496  transferase (Gpi7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05260)  21.67 
 
 
847 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000895802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>