47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1274 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  97.39 
 
 		 278 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  97.39 
 
 		 273 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  97.01 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  78.36 
 
 		 268 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  77.61 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  76.87 
 
 		 268 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  75.28 
 
 		 291 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  74.16 
 
 		 269 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  74.16 
 
 		 269 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  68.94 
 
 		 274 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  68.68 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  70.08 
 
 		 265 aa  363  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  60.95 
 
 		 274 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  60.77 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.33 
 
 		 282 aa  329  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  50.19 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  48.48 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  48.11 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  48.61 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  36.84 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  34.3 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.88 
 
 		 499 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.39 
 
 		 499 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.62 
 
 		 478 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 		 558 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.54 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.95 
 
 		 433 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  30.15 
 
 		 428 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  28.24 
 
 		 531 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.22 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.47 
 
 		 431 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.16 
 
 		 431 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.11 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.58 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  41.94 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.73 
 
 		 417 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.81 
 
 		 445 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 		 467 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.37 
 
 		 496 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37402  predicted protein  34.52 
 
 		 890 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.85 
 
 		 489 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  22.65 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 		 558 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  23.01 
 
 		 417 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  21.76 
 
 		 713 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>