264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0987 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  849    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3283  putative phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 
521 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0744352  normal  0.559015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0807  metalloenzyme  31.39 
 
 
484 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.897357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  26.76 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 
530 aa  62  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  35.25 
 
 
552 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  37.27 
 
 
514 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  33.93 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  34.23 
 
 
515 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  34.23 
 
 
515 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  34.23 
 
 
515 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  35.71 
 
 
505 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.64 
 
 
336 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  37.8 
 
 
505 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  34.19 
 
 
552 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
510 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  38.1 
 
 
621 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
506 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  38.1 
 
 
621 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
510 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  38.1 
 
 
621 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.81 
 
 
499 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  27.15 
 
 
268 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  38.74 
 
 
657 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  28.24 
 
 
350 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  31.43 
 
 
511 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  28.29 
 
 
615 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  30.83 
 
 
486 aa  53.9  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  32.54 
 
 
512 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  33.64 
 
 
514 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  30.36 
 
 
492 aa  53.1  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
514 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  35.48 
 
 
513 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  28.48 
 
 
268 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  25.58 
 
 
487 aa  53.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  35.07 
 
 
515 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  32.37 
 
 
512 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  30.77 
 
 
507 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  32.37 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  21.5 
 
 
601 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  32.59 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.53 
 
 
499 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  35.45 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  28 
 
 
525 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  32.23 
 
 
516 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  31.75 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  28.57 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  33.64 
 
 
513 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  25.39 
 
 
628 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  31.82 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  29.37 
 
 
390 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  27.15 
 
 
287 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 
514 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 
514 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  35.16 
 
 
512 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  30.95 
 
 
516 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  30.95 
 
 
511 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.15 
 
 
268 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  30.87 
 
 
269 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  31.45 
 
 
514 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 
478 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  28.03 
 
 
515 aa  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  26.71 
 
 
511 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
509 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
509 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
509 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
509 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
509 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 
509 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  33.8 
 
 
512 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.41 
 
 
278 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  30.95 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  32.31 
 
 
513 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00280  phosphoglycerate mutase, putative  27.46 
 
 
532 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  29.46 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  32.26 
 
 
521 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  35.96 
 
 
630 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  39.62 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.41 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  28.91 
 
 
515 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  30.95 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  39.62 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  30.63 
 
 
514 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  37.74 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  31.45 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  24.74 
 
 
628 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>