252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1508 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  62.45 
 
 
511 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  60.43 
 
 
516 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  65.56 
 
 
512 aa  695    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  61.69 
 
 
513 aa  652    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  59.88 
 
 
513 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 
514 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  100 
 
 
512 aa  1060    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  98.83 
 
 
512 aa  1049    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  63.74 
 
 
514 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  64.01 
 
 
511 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  60.08 
 
 
516 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  59.18 
 
 
512 aa  627  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
511 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  58.98 
 
 
512 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 
505 aa  620  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 
509 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  58.72 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 
512 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  58.71 
 
 
510 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  58.53 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  58.4 
 
 
509 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  58.2 
 
 
509 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  58.67 
 
 
512 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  58.2 
 
 
509 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  56.92 
 
 
513 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  58.2 
 
 
509 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  58.28 
 
 
512 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 
515 aa  594  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
509 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  56.2 
 
 
518 aa  588  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  58.82 
 
 
513 aa  586  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  55.17 
 
 
516 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  57.78 
 
 
517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 
521 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  55.27 
 
 
515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 
516 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  55.64 
 
 
514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  55.13 
 
 
521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  55.73 
 
 
525 aa  565  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
514 aa  568  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  54.12 
 
 
514 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
514 aa  568  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 
516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  52.93 
 
 
515 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  53.32 
 
 
514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  53.32 
 
 
511 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  54.01 
 
 
510 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  54.01 
 
 
508 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 
509 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  52.73 
 
 
511 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 
514 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  53.22 
 
 
515 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  52.93 
 
 
511 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 
518 aa  555  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.64 
 
 
510 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  52.64 
 
 
529 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  53.11 
 
 
513 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  53.03 
 
 
513 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  53.2 
 
 
515 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  53.31 
 
 
505 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  52.93 
 
 
511 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  53.4 
 
 
515 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  52.82 
 
 
515 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 
505 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 
505 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  52.64 
 
 
510 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  54.09 
 
 
510 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  55.47 
 
 
510 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  52.64 
 
 
513 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
514 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
514 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  53.12 
 
 
509 aa  545  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  52.15 
 
 
511 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.53 
 
 
532 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>