236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4716 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  100 
 
 
511 aa  1056    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  58.15 
 
 
512 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
512 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  60.27 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 
512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  57.45 
 
 
516 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  58.2 
 
 
511 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  57.73 
 
 
512 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  56.27 
 
 
513 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  57.34 
 
 
513 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  59.69 
 
 
512 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  57.37 
 
 
516 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  55.86 
 
 
512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  59.96 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  55.99 
 
 
515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  58.12 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  56.16 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 
509 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 
509 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 
509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  56.27 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 
509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 
513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  58.4 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 
509 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 
509 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 
514 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 
514 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  54.76 
 
 
518 aa  566  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 
517 aa  558  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 
516 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 
525 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 
511 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  52.05 
 
 
513 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  54.22 
 
 
521 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 
515 aa  545  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  53.53 
 
 
511 aa  545  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 
514 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
538 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 
505 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  53.92 
 
 
511 aa  527  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 
532 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
514 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 
514 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 
514 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
514 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 
505 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
514 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 
505 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
514 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
515 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
514 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 
513 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  52.15 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 
513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
516 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 
509 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
514 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 
508 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
514 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
511 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 
514 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
518 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
514 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 
514 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
507 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  50 
 
 
515 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
515 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 
511 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
513 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  51.56 
 
 
515 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
514 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.8 
 
 
510 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
529 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
517 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
514 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
524 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
517 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
515 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.29 
 
 
514 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 
520 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
514 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
509 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
514 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
514 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  50 
 
 
510 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>