238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0140 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  62.8 
 
 		 513 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  64.01 
 
 		 512 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  63.81 
 
 		 512 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  66.73 
 
 		 514 aa  712    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  71.68 
 
 		 512 aa  766    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 511 aa  1055    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  62.18 
 
 		 514 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  75.73 
 
 		 511 aa  824    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  60.55 
 
 		 516 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  59.18 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  60.24 
 
 		 509 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  60.08 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  59.8 
 
 		 516 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  58.63 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  59.1 
 
 		 517 aa  608  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  58.95 
 
 		 511 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 		 512 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  59.06 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  58.87 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  59.84 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  58.28 
 
 		 512 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  58.09 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  57.42 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  58.82 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  57.12 
 
 		 513 aa  591  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  53.59 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  56.61 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  53.4 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  55.8 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  55.99 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 		 509 aa  571  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 		 511 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.82 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  55.8 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  55.21 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  54.78 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  55.93 
 
 		 521 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  53.59 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  54.22 
 
 		 510 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  54.81 
 
 		 508 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  54.17 
 
 		 521 aa  556  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  55.23 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  52.56 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 518 aa  554  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  54.22 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1890  phosphoglyceromutase  53.63 
 
 		 540 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  53.74 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  53.35 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  52.17 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 515 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 515 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.65 
 
 		 514 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  51.16 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 514 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 		 519 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 		 514 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  53.74 
 
 		 510 aa  537  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  53.14 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 		 511 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  53.35 
 
 		 510 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  51.64 
 
 		 552 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  52.53 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  52.53 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>