279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2988 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 516 aa  1070    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  61.45 
 
 		 513 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  61.34 
 
 		 514 aa  648    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  60.43 
 
 		 512 aa  641    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  60.23 
 
 		 512 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  63.35 
 
 		 512 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  62.72 
 
 		 509 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  65.75 
 
 		 513 aa  709    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  76.55 
 
 		 516 aa  849    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  60.55 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 512 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  58.95 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  56.84 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  57.34 
 
 		 512 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  57.84 
 
 		 509 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  57.84 
 
 		 509 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  57.34 
 
 		 517 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  57.45 
 
 		 509 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 518 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  57.25 
 
 		 509 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  57.45 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  57.45 
 
 		 509 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  56.74 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  58.15 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  57.06 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  57.45 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  57.53 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  55.75 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  55.77 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 		 515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  55.66 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  56.16 
 
 		 512 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 		 515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 		 514 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  56.34 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  53.89 
 
 		 511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  51.56 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  53.97 
 
 		 521 aa  551  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  54.84 
 
 		 519 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  53.49 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  52.13 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  53.1 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  54.47 
 
 		 510 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  51.84 
 
 		 510 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  51.94 
 
 		 529 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 		 515 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 		 515 aa  541  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 519 aa  539  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.56 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 519 aa  538  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 		 514 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  53.59 
 
 		 510 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  52.13 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  52.6 
 
 		 515 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  52.45 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 514 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  50.87 
 
 		 514 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  51.26 
 
 		 517 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.95 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  52.13 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  51.75 
 
 		 532 aa  531  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 		 518 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>