239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3774 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  72.21 
 
 
513 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  68.49 
 
 
512 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  71.4 
 
 
512 aa  742    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  76.52 
 
 
512 aa  819    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  100 
 
 
512 aa  1056    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  69.35 
 
 
510 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  96.87 
 
 
512 aa  1026    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  59.03 
 
 
516 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  60.63 
 
 
514 aa  624  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  59.61 
 
 
516 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  58.64 
 
 
516 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  59.14 
 
 
512 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  59.22 
 
 
516 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  58.35 
 
 
513 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  57.17 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  58.4 
 
 
511 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  58.28 
 
 
512 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  58.28 
 
 
512 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  58.28 
 
 
511 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
509 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  56.16 
 
 
516 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  58.4 
 
 
511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  56.42 
 
 
517 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  56.53 
 
 
515 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  55.14 
 
 
511 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 
505 aa  567  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  56.3 
 
 
516 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 
512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 
513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  56.03 
 
 
511 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  53.92 
 
 
525 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 
515 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 
514 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  54.28 
 
 
514 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
518 aa  558  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 
515 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  54.97 
 
 
514 aa  552  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 
508 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.8 
 
 
513 aa  548  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  52.17 
 
 
518 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 
511 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  53.49 
 
 
523 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 
510 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 
514 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 
514 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 
511 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  54.3 
 
 
511 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  53.53 
 
 
514 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
514 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
514 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 
514 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
514 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 
514 aa  541  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 
514 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  53.62 
 
 
513 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
514 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
520 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  53.71 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 
529 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 
514 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 
514 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 
511 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
513 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  52.45 
 
 
509 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 
511 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 
524 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 
509 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 
511 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 
509 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 
521 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  52.73 
 
 
524 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  53.62 
 
 
510 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
509 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
509 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  53.8 
 
 
509 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
509 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 
509 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  53.03 
 
 
510 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 
513 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
513 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
509 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
509 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 
509 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 
509 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  53.92 
 
 
510 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 
557 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
511 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
517 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 
517 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  52.13 
 
 
525 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.95 
 
 
511 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 
514 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.66 
 
 
510 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 
521 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 
519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 
514 aa  514  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
514 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>